Novel Di bawah Panji Islam mengangkat tema perjuangan dan keteguhan iman dalam menghadapi berbagai tantangan sosial dan politik. Najib al-Kaylani menampilkan kisah tokoh-tokoh yang teguh mempertahankan nilai-nilai Islam sambil berusaha menjaga keutuhan masyarakatnya dalam kondisi yang penuh konflik. Cerita ini memperlihatkan dinamika kehidupan yang sarat dengan ujian, sekaligus memberikan gambaran bagaimana semangat dan solidaritas dalam bingkai agama mampu menjadi kekuatan utama dalam membangun peradaban dan keadilan sosial.